Acuerdo de Santo Domingo, 1994

José Francisco Peña Gómez fue como candidato en las elecciones de 1990 fruto de la división de su partido que existía luego de los comicios de 1986. Pero en 1994 el partido se recompone a la figura de Peña y forma el Acuerdo de Santo Domingo junto con otros partidos de Centro y de Centro-Izquierda dominicanos. De esa forma logra ganar las elecciones de ese año con más del 38% de los votos, pero que al final fueron arrebatadas por Joaquín Balaguer y el PRSC dando comienzo a la crisis política mas grave de la democracia moderna dominicana en 32 años. Al final, se permitió a Balaguer obtener el poder pero convocando a elecciones originalmente para Noviembre de 1995, pero que las fuerzas conservadoras del país las fijaron para mayo de 1996. En ese año el PRD y el Acuerdo de Santo Domingo con Peña Gómez a la cabeza ganaron la primera vuelta con el 46% de los votos, pero una alianza entre Joaquín Balaguer y el candidato del PLD y el segundo mas votado Leonel Fernández llamado Frente Patriótico, provocaron la derrota por estrecho margen (1.05%) en la segunda vuelta. En las elecciones congresionales y municipales de 1998, el PRD arrasa después de la muerte de su líder histórico Peña Gómez aquejado de cáncer de páncreas. Su muerte se produjo 6 días antes, el 10 de Mayo. El Partido obtuvo 25 de las 29 senadurías de entonces, la mayoría absoluta en la cámara de diputados y muchas alcaldías del país.